互殴不会留下案底。互殴会被治安拘留，而治安拘留是不会留下案底的。案底一般指某人过去犯法或犯罪行为的记录，又称犯罪人员犯罪记录制度，在相关法律中一般指有过刑事犯罪前科的档案记录，而该犯罪档案一般存放至公安部门保存。
犯罪记录制度是现代社会管理制度中的一项重要内容。为适应新时期经济社会发展的需要，进一步推进社会管理创新，维护社会稳定，促进社会和谐，现就建立犯罪人员犯罪记录制度提出如下意见。对于因民间纠纷引起的打架斗殴或者损毁他人财物等违反治安管理行为，情节较轻的，公安机关可以调解处理。经公安机关调解，当事人达成协议的，不予处罚。
法律依据：《中华人民共和国治安管理处罚法》第二十六条
有下列行为之一的，处五日以上十日以下拘留，可以并处五百元以下罚款；情节较重的，处十日以上十五日以下拘留，可以并处一千元以下罚款：
（一）结伙斗殴的；
（二）追逐、拦截他人的；
（三）强拿硬要或者任意损毁、占用公私财物的；
（四）其他寻衅滋事行为。
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